FIDOアライアンス認定プログラム事務局は、認定プロセスにおいて重要な役割を果たします。
認証事務局
認証事務局は、FIDO2、U2F、UAF 認証器およびサーバ、パスキープロバイダ、顔、指紋、虹彩、および音声コンポーネントのバイオメトリクス、文書認証（DocAuth）および顔認証コンポーネントのリモート ID 検証、ならびに FDO デバイス、オンボーディングサービス、およびランデブーサーバの Device Onboarding を含む、すべての FIDO 認証プログラムの全般的な提供に責任を負う。 認定には、適合性および相互運用性試験の監督、新規プログラムの開発、現行プログラムの保守、FIDO認定試験所の管理、証明書処理、請求書発行、商標の監督などが含まれる。
安全保障事務局
セキュリティ事務局は、オーセンティケータ認証プログラムの管理に責任を負う。 これには、申請書の審査と承認、アンケート、セキュリティ脅威の監視、認定セキュリティ・ラボとの調整などが含まれる。 さらに、セキュリティ事務局は、FIDO 認証機関認定の独立したセキュリティ専門家としての役割を果たす。
バイオメトリック事務局
バイオメトリクス事務局は、バイオメトリクス認証プログラムの管理に責任を負う。 これには、申請書の審査と承認、ラボ評価報告書、プログラムの更新、認定バイオメトリック・ラボとの調整などが含まれる。 さらに、バイオメトリック事務局は、FIDO バイオメトリック認証のための独立したバイオメトリック専門家としての役割を果たす。
本人確認事務局
Document Authenticity (DocAuth) 事務局は、Document Authenticity (DocAuth) 認証プログラムの管理責任を負う。 これには、認証申請書、ラボ評価報告書、プログラムの更新、認定文書真正性（DocAuth）ラボとの調整のレビューと承認が含まれます。 さらに、DocAuth 事務局は、FIDO 文書認証（DocAuth）認証のための独立したアイデンティティ専門家としての役割を果たす。
